２０２４（令和６）年７月２４日（水）１２時３２分頃、山口県山口市のＪＲ西日本山陽本線新山口駅構内で、走行中の福岡貨物ターミナル駅発東京貨物ターミナル駅行貨物列車（ＪＲ貨物ＥＦ２１０形式電気機関車１両＋貨車２３両編成・乗員１名）の、機関車の先頭１軸２輪が脱線した。。
機関車の車軸が折れたため。
山陽本線の大道・厚東間に加えて、山口線の全線（新山口・益田間）も２６日１５時頃まで不通。事故の原因を調査する過程で９月１０日に、ＪＲ貨物での車両の車軸に車輪をはめる作業において規格外の圧力値を改ざんし規格内とした事例が５６４両分発覚、点検の対象となる車両を探すために日本全国でＪＲの貨物列車が丸一日止まった。さらに国土交通省の点検指示によりＪＲ東海や東京メトロなど他社でも同様の事例が発覚し、列車の運休や編成の短縮が起きた。
２０２４（令和６）年７月２２日（月）３時３７分、愛知県蒲郡市のＪＲ東海東海道新幹線豊橋・三河安城間の上り線で、停止していた保守用車両（マルチプルタイタンパ１両）に、他の保守用車両（砕石運搬散布車６両と軌道モータカー３両の９両編成）が衝突した。マルチプルタイタンパの後方３軸と軌道モータカーの前方１軸が脱線、係員４名が重軽傷。
砕石運搬散布車のブレーキ力が大きく低下した状態で走行したため。
東海道新幹線の浜松・名古屋間が２２時過ぎまで運休し、約２５万人に影響。東京・浜松間と名古屋・新大阪間で各駅停車のみ毎時２往復程度が運転された。新幹線各駅が待ち客であふれ、北陸新幹線、特急サンダーバード、近鉄特急、全日空、日本航空などで臨時便が出た。
２０２３（令和５）年９月２５日（月）１２時頃から、青森県の弘南鉄道は、弘南線と大鰐線の全線全列車を運休した。
線路が傷んだため。８月６日の大鰐駅でのレールの摩耗による列車の脱線を受けて、外部の研究機関に線路の検査を委託したところ、６箇所でレールの交換基準を上回る摩耗が見つかった。鉄道会社にお金と技術がなく、従業員が減り、検査が不十分であったうえ、修理に時間を要した。
弘南線の弘前・田んぼアート間が１０月２５日（水）まで、田んぼアート・黒石間が１１月６日（月）まで、大鰐線の津軽大沢・中央弘前間が１１月１９日（日）まで、大鰐・津軽大沢間が１２月７日（木）まで運休。バス代行輸送が１０月２日（月）まで開始できず、旅客鉄道輸送が丸一週間止まったはずが、運休本数や影響人数は公表されていないほか、不便だとの声がマスコミに拾われた以外の影響が伝わってこない。
２０２３年８月１０日(木)、スイスのウーリ州とティチーノ州を結ぶゴッタルドベーストンネルで、貨物列車の貨車３０両中１６両が脱線した。
貨車の車輪が割れたため。
列車が約８キロメートルもの線路を壊したため、単線２本のトンネルのうち１本が不通。貨物列車は単線での運転となり、旅客列車は非常時対応の問題でトンネルを通れず旧線を迂回し所要時間が１時間以上増え、いずれも輸送力が落ちた。１０月からは金土日曜のみ旅客列車もトンネルを経由。復旧には２０２４年９月１日までかかり、約１５０億スイスフラン(約２．６兆円)の費用を要した。ゴッタルドベーストンネルは全長５７１０４メートルと５７０１７メートルの世界最長の鉄道トンネルで２０１６年に開通。
２０２３（令和５）年８月５日（土）２１時２４分頃、神奈川県鎌倉市の東日本旅客鉄道東海道本線大船・藤沢間の大船駅構内で、小田原発横浜行臨時普通列車（Ｅ２３１系電車５両＋Ｅ２３３系電車１０両編成・乗客１，０００名以上）の列車の先頭車が電化柱に衝突し停止した。運転士と乗客２名が軽傷。
電化柱が線路内に倒れたため。設計耐力の８割の力がかかる鉄筋コンクリリートの電柱に、何らかの理由でひび割れが生じ、水がしみ込み鉄がさびて、鉄筋が切れて柱が折れた。列車は神奈川県茅ヶ崎市の花火大会「第４９回サザンビーチちがさき花火大会」や同県小田原市の「第３４回小田原酒匂川花火大会」の観客輸送で臨時に運行されていた。
東海道線東京・熱海間に加えて、停電により「横須賀線」東京・久里浜間や根岸線が翌朝まで運休。これらの区間に直通する列車にも遅れや運休が相次ぎ、約１５万人の足に影響。停電により駅間で１時間以上停止した１３本の列車内で熱中症にかかったり、駅で停止した列車内で翌朝まで過ごした客が出た。寝台特急列車「サンライズ瀬戸・出雲」が客を乗せて翌朝まで東京駅で抑止のうえ運休。夜の東海道新幹線上り「のぞみ」「ひかり」が熱海駅や小田原駅に臨時停車し客を運んだ。
２０２２（令和４）年１１月１９日（土）０時３０分頃、栃木県宇都宮市のＪＲ宇都宮駅東口で、電車（宇都宮ライトレールＨＵ３００形電車３両編成）の１両目全４輪と２両目の後方２輪が軌道から逸脱して停止した。
急曲線で車輪がレールに強く押し付けられて乗り上がった。現場は２０２３年８月に開業予定の宇都宮ライトレール宇都宮芳賀ライトレール線（ライトライン）宇都宮駅東口停留場の分岐器に近い、半径２５メートルの急カーブ。前々日から電車の試運転が始まり、開業後の営業運転で使わない緊急時のルートに電車を走らせたところ脱線した。
電車が脱線しにくくなるよう、施設を所有する宇都宮市で、４千万円かけて宇都宮駅東口停留場の曲線のカントをなくす工事と軌間を縮める調整を実施。車両等の復旧に約１億円。該当のルートでの緊急走行時に列車速度を時速１５キロから５キロに下げる。路線の工事には影響なく、予定どおり２０２３年８月２６日に開業した。
２０２２（令和４）年５月２７日（金）０時２１分頃、和歌山県橋本市の南海電気鉄道小原田（おはらた）車庫の分岐器で、車両（３００００系電車４両編成）が脱線した。
運転士が停止信号を見落とし、開通していない分岐器へ車両を進入させたため。
特急用電車が車庫から出られなくなり、５月３１日まで高野線の特急列車すべてを全車自由席の一般車両で運行。以後も特急車両の不足で２０２３年４月２８日まで、高野線特急が一部運休し、８両編成の列車が４両編成になった。また、１１月から２０２３年９月まで、難波・和泉中央間の特急「泉北ライナー」の一部列車に空港特急ラピート向け電車が使われた。
２０２２（令和４）年４月２５日（月）１８時１０分頃、奈良県大和郡山市の近畿日本鉄道橿原線近鉄郡山・筒井間の郡山第２踏切で、女性が橿原神宮前発京都行特急列車（電車４両編成）にはねられ死亡した。列車の乗員乗客に負傷者なし。
女性が遮断機の下りた踏切内にいたため。防犯カメラの映像により、全盲の視覚障害を持つ女性が、踏切を渡る途中で下りた遮断機の手前を、踏切の外と勘違いしたのではないかと報道される。
大和郡山市では踏切内の点字ブロックを敷き直した。国土交通省は６月に「道路の移動等円滑化に関するガイドライン」を改定し、踏切道への視覚障害者誘導用ブロックの設置を推奨、２０２４年１月には同ガイドラインを再改定し、誘導ブロックを含む踏切道内誘導表示の設置を標準化した。全国の踏切で路面標示や点字ブロックの追加が進んだ。
２０２２（令和４）年３月１６日（水）２３時３６分頃、宮城県白石市の東日本旅客鉄道東北新幹線福島・白石蔵王間の高架橋で、東京発仙台行新幹線列車「やまびこ２２３号」（Ｅ６系新幹線電車７両＋北海道旅客鉄道Ｈ５系新幹線電車１０両編成・乗員５名乗客７８名）の、１３号車（前から５両目）を除く１６両が脱線した。当初報道では乗員３名、負傷者なしとされたが、後日に訂正された。
地震のため。福島県沖を震源とする最大震度６強の地震が発生し、東北新幹線の橋脚や電柱が壊れる被害が出た。
地震の影響もあり東北新幹線が４月１３日まで、最大で那須塩原・盛岡間で運休。２００４年１０月の上越新幹線とき３２５号以来となる新幹線の営業列車の脱線は、テレビや新聞などで大きく繰り返し報道された。
２０２１（令和３）年１１月１１日（木）、東京都渋谷区の東日本旅客鉄道渋谷駅の埼京線ホームについて、視覚障害者用の音声案内スピーカーが誤った方向に設置されていると報道された。
ＪＲ東日本がスピーカーを設置する際、バリアフリー新法に基づく国土交通省令に関するガイドラインの趣旨によらず旅客動線を考慮し、ホーム長軸方向でなく短軸方向に音響が流れる向きに設けたため。音声案内の方向を頼りにホーム上を移動した視覚障碍者が線路に転落しかねないと指摘された。
ＪＲ東日本は謝罪し、管内の５９駅でスピーカーの向きを変更。国土交通省は旅客鉄道事業者に確認と報告を通知。
２０２１（令和３）年１０月７日（木）２２時４１分頃、東京都足立区の東京都交通局日暮里・舎人ライナーの舎人公園駅構内で、日暮里発見沼代親水公園駅行列車（３００形電車５両編成・乗員なし乗客約３０名）の先頭車の前台車が走行路を外れた。
地震のため。千葉県北西部を震源とする最大震度５強の地震が発生した。指令が緊急地震速報により、すべての列車を非常停止する操作をしたところ、該当の列車が分岐部で走行路を外れた。交通局では「前３両が脱輪」と表記。日暮里・舎人ライナーは車両がゴムタイヤでコンクリートの路面を走行する「新交通システム」であり、報道等では「脱線」「脱輪」などの表現が混乱した。
線路の支障と設備の損傷で、日暮里・舎人ライナーは１０日まで全線で運休。
２０２１（令和３）年８月６日（金）２０時３０分頃、東京都世田谷区の小田急電鉄小田原線成城学園前・祖師ヶ谷大蔵間を走行中の藤沢発新宿行快速急行列車（５０００形１０両編成・乗員乗客数不明）の車内で、男が乗客に切り付けた。乗客１０名が重軽傷。
男の刃物と油による無差別な殺人未遂放火未遂事件。５０００形電車は小田急で初めて車内防犯カメラを搭載した車両であり、容疑者（手配前にコンビニで自首）の速やかな特定につながったと考えられる。
事件はテレビやネットなどで大きく報じられ、鉄道各社では警備を強化。国土交通省は鉄道事業者に警備の強化や防犯カメラの活用などの対策を求めようとしたところ、１０月３１日（日）１９時５５分頃に東京都調布市の京王電鉄京王線布田・国領間を走行中の新宿行特急列車（８０００系電車１０両編成。）の車内でも、男が刃物と燃料で無差別な殺人未遂放火事件を起こし１６名の重軽傷者を出したことで、鉄道各社はさらに警備を強化し、国土交通省は鉄道事業者に避難誘導の徹底や防犯設備の充実に手荷物検査の検討などの対策を求めた。国土交通省は２０２３年１０月１５日から、新幹線や三大都市圏の新車を対象に、録画できる防犯カメラの設置を義務化した。
２０２１（令和３）年６月７日（月）２３時頃、東京都中央区の東京地下鉄日比谷線八丁堀駅のバリアフリートイレ内で警備員が倒れた男性を発見、病院で死亡が確認された。
男性の病気によるもの。２０２２年３月の報道で、男性が約７時間トイレ内にいたこと、通報装置のブレーカーが切られて駅事務室に通報されない状態であったこと、トイレ内に３０分以上在室した場合に駅事務室へ警報するケーブルがつながっていなかったことが判明。
東京メトロは謝罪し設備の点検と改修を実施。国土交通省は各鉄道事業者に注意喚起。
２０２０（令和２）年４月２１日（火）１５時２５分頃、長崎県長崎市の長崎電気軌道諏訪神社前・公会堂前間の交差点で、３系統蛍茶屋発赤迫行列車（電車１両編成・乗員１名乗客５名）が脱線した。
運転ミス。交差点を右折するための切換装置の誤操作により、車両の前方の台車が右折した後、後方の台車が直進してしまい脱線した。
蛍茶屋・市民会館間が一時運休した。事故の原因について新聞やライターが誤報を連発した。
２０１９（令和元）年１２月２４日（火）１９時０８分頃、福島県南会津郡下郷町の会津鉄道会津線弥五島（やごしま）・塔のへつり間で、東武日光発会津若松行列車（ＡＴ−６５０形気動車１両編成・乗員２名乗客３名）が脱線した。
線路の老朽化のため。軌道のまくらぎと締結装置の不良で、列車の走行により軌間が拡大、列車の車輪がレールとレールの間に落ちた。鉄道会社にお金と技術がなく、脱線箇所での不良の把握や軌道の整備が行われていなかった。
会津鉄道が２７日まで全線で運休。鉄道会社はまくらぎの木製からコンクリート製への交換を引き続き進めることとし、線路の点検と補修に関するルールを見直した。前月の１１月２７日にも土砂災害での脱線事故が起きていた会津鉄道では車両が不足し、東武日光・会津若松間「ＡＩＺＵマウントエクスプレス」３往復のうち１往復を運休、２０２１（令和３）年３月のダイヤ改正で廃止した。
２０１９（令和元）年１０月１３日、長野県長野市の東日本旅客鉄道長野新幹線車両センターが冠水、留置されていた新幹線電車の天井付近まで水没した。
台風１９号（令和元年東日本台風）による大雨で千曲川が決壊し、雨水が一帯へ流入したため。北陸新幹線の整備主体である鉄道・運輸機構がここに車両基地を設け、後に長野市が１０ｍから２０ｍの冠水を予測するハザードマップを公開していた。広大で平坦な整形地が必要な鉄道の車庫は昔から、冠水や軟弱地盤など何らかの問題があるから市街化されなかった土地に設けられることが多く、過去にも１９８２年８月の国鉄関西本線王寺駅など、車庫が水没したり、車庫の水没で車両が廃車となる出来事が起きてきた。
北陸新幹線の長野・上越妙高間が１０月２４日まで不通。長野新幹線車両センターは車両検修の機能を失った。水没時の留置車両すべて、ＪＲ東日本のＥ７系電車８編成９６両と、ＪＲ西日本のＷ７系電車２編成２４両が廃車。上越新幹線向けに製造中のＥ７系電車を北陸新幹線に流用したため、２０２０年度末に予定していたＥ４系新幹線電車、オール二階建て車両「Ｍａｘ」の全廃が２０２１年１０月まで延期された。ＪＲ東日本では大雨の予報で車両を避難させることにした。ＪＲ東日本は鉄道・運輸機構と協議のうえ、車両基地の浸水対策を進めていくとしている。
２０１９（令和元）年９月５日（木）１１時４０分頃、神奈川県横浜市の京浜急行電鉄（京急）本線神奈川新町駅付近の神奈川新町第１踏切で、青砥発三崎口行快特列車（１０００形電車８両編成・乗員２名乗客約５００名）が大型トラックと衝突、前３両が脱線し先頭車が炎上した。トラックの運転手は死亡。乗員２名と乗客７５名が重軽傷。
大型トラックが踏切内で立ち往生したため。道に迷ったと考えられる。加えて列車の運転士が踏切支障の信号を見落としてブレーキ操作が遅れたため。
京急川崎・横浜間が９月７日１３時過ぎまで不通。電車の全８両が廃車。京急は該当の信号機を移設したほか、踏切支障を示す信号の発光では非常ブレーキを扱うよう規程を改正した。壮絶な踏切事故として京急ファンの記憶に残る。この年の横浜市内では下記のとおり鉄道事故が続いた。
※２０２３年８月補訂：運輸安全委員会の鉄道事故調査報告書に基づき乗員乗客数を追加し負傷者数を訂正２０１９（令和元）年８月２９日（木）８時３７分頃、神奈川県横浜市の横浜市交通局１号線（横浜市営地下鉄ブルーライン）踊場駅で、回送列車（３０００Ｎ形電車６両編成・乗員１名）が引上線で停止位置を過ぎて行き止まりのトンネル壁面に衝突した。運転士が負傷。
車両の運転ミス。運転士が眠り、ブレーキをかけなかったという。事故後の検査で重症のＳＡＳ（睡眠時無呼吸症候群）であったことが判明。踊場駅止まりの列車が引上線で折返し踊場駅始発の列車になる間に、事故が起きた。
踊場駅での普通列車の折返し運転ができなくなったことで、９月７日まで快速列車を運休。電車の全６両が廃車。６月６日の脱線事故とこの事故でブルーラインの車両が不足し、翌２０２０年の１月３１日に平日朝ラッシュ時間帯の運転間隔を４分２０秒から４分３０秒に変えるダイヤ改正を実施した。
２０１９（令和元）年６月６日（木）５時２２分頃、神奈川県横浜市の横浜市交通局１号線（横浜市営地下鉄ブルーライン）立場・下飯田間のトンネル内で、湘南台発あざみ野行列車（３０００Ｓ形電車６両編成・乗員１名乗客１２１名）の前４両が脱線した。
横取り装置の復位忘れ。夜間の点検で、レールにレールを被せて車両の進行方向を変える手動式の分岐器「横取り装置」を操作し、これを元に戻さずに列車を走らせたため、列車の車輪が分岐器に乗り上げて脱線した。２００９年２月の近鉄東青山駅列車脱線事故と同じケース。
踊場・湘南台間が６月１０日午前中まで約４日半運休。横浜市は職員７人に停職や減給などの処分をした。電車の全６両が廃車。
２０１９（令和元）年６月１日（土）２０時１５分頃、神奈川県横浜市の横浜シーサイドライン金沢シーサイドライン新杉田駅で、新杉田発並木中央行列車（２０００型電車５両編成・乗員なし乗客２５名）が車止めに衝突した。
車両の制御に使うケーブルが走行中に切れたため、無人運転の列車が折り返す駅でモーターの回転方向が変わらず、発車時に列車の進行方向と反対側の車止めに向かって加速した。車両の設計時に鉄道会社と車両メーカーと部品メーカーの考えがすれ違い、断線で機器が思わぬ動きをしてしまった。
シーサイドラインの全線が６月４日１１時まで約２日半運休。以後も有人での運転や監視の実施により１２月１日まで減便運行。
現地時間２０１８年１０月２１日（日）１６時５０分頃、台湾の宜蘭県の台湾鉄路管理局（台鉄）宜蘭線新馬・蘇澳新間で、樹林発台東行自強号６４３２次普悠瑪（プユマ）号（ＴＥＭＵ２０００型電車８両編成・乗客３６６名）のすべての車両が脱線、うち４両が転覆した。
列車の速度超過のため。列車は時速７５ｋｍの速度制限を受ける半径３０６ｍの曲線を時速１４１ｋｍで走行し脱線転覆した。列車の運転士は車両の故障警告表示を受け、運転指令の指示より花蓮駅まで運転することとなり、ＡＴＰ（列車が制限速度を超えたり信号を冒進するとブレーキをかける保安装置）の機能を停止させ列車を走らせた。台鉄は事前に車両の不具合を把握していたが、車両の製造時の契約により修理できなかったという。
宜蘭線が約半日運休。台鉄は車両とＡＴＰを点検し、教育訓練と管理態勢を見直したほか、ＡＴＰに機能停止時の時速６０ｋｍ制限と時速６３ｋｍ発動の仕組みを設けた。台湾政府は鉄道事故の原因を調査し再発を防止する組織の設置を決め、２０１９年８月に航空分野の飛航安全調査委員会に鉄道分野を含めて国家運輸安全調査委員会に改称した。ＴＥＭＵ２０００型電車は台鉄が日本の住友商事に発注し日本車輌製造が製造した電車であり、台鉄は住友商事に損害賠償請求訴訟を起こした。１１月の台北駅での駅弁大会が中止された。
２０１７（平成２９）年１２月１１日（月）１７時３分頃、愛知県名古屋市の東海旅客鉄道東海道新幹線名古屋駅で、博多発東京行列車「のぞみ３４号」（西日本旅客鉄道Ｎ７００系新幹線電車１６両編成・乗員４名乗客約１，０００名）の運行を、異臭の発生により打ち切った。
先頭から４両目（１３号車）の台車にひびが入ったため。振動で周囲の部品が壊れ、油漏れや発熱が起きた模様。列車では博多駅の出発後に車内で、焦げたにおい、モヤ、甲高い音、若干の振動を乗務員が断続的に確認していて、運輸指令への連絡や車両保守係員の確認が行われていたが、結果的に３時間以上も列車を通常に運行した。台車の製造時に位置合わせで基準を超えて部材を削ったことで強度が落ち、普段はひび割れが起きない場所にひびが入ったのではないかと考えられている。
マスコミが例の「安全神話の崩壊」というフレーズで新幹線の不安をあおり、ＪＲ西日本を袋叩きにした。国土交通省はすべての新幹線台車の点検を指示、台車を作った川崎重工はＪＲ東海とＪＲ西日本に納入した基準外の台車約１４０台分を新品に交換。国の運輸安全委員会は規定により事故調査の対象としない考えであったが、公明党の石井啓一国土交通大臣の指示により「重大インシデント」として調査を開始、２００１年１０月の制度発足後初となる新幹線での重大インシデントの発生となった。故障車両の留置で１２月１７日まで名古屋駅１４番線が使えず、ダイヤの変更で岐阜羽島駅にのぞみ号が臨時停車した。
２０１７（平成２９）年５月２２日（月）１５時頃、群馬県桐生市のわたらせ渓谷鐵道わたらせ渓谷線花輪・水沼間で、間藤発桐生行回送列車（東日本旅客鉄道キヤ１９３系気動車３両編成・乗員７名）の中間車が脱線した。
線路の老朽化。赤字ローカル線の弱い線路に、普段は来ない重たい列車が載ったことで、まくらぎが壊れてレールが倒れた。脱線した車両は、ＪＲ東日本が所有する検測車両、愛称「Ｅａｓｔ ｉ−Ｄ（イーストアイ・ダッシュディー）」。走りながら信号、通信、電力、軌道の状態を測定でき、自社で使うほか他社にも貸し出している。
わたらせ渓谷鉄道は６月９日まで大間々・間藤間を運休し、まくらぎの検査や交換を実施。国や県などの補助金で、２０１８年度から５年間で１７億１４００万円かけて、まくらぎのコンクリート化や太いレールへの交換を実施する予定。脱線シーンがたまたま鉄道ファンにより動画で撮影されていて、これがテレビのニュースで放送された。検測車両が事故後半年間ほど使われず、以後も脱線した電力関係測定車両を抜いて走るため、各社の検測に影響が出たのではないかと思う。
２０１６（平成２８）年６月２日（木）２２時５０分頃、長崎県長崎市の長崎電気軌道諏訪神社前・公会堂前間の交差点で、３系統蛍茶屋発赤迫行列車（３６０形式電車１両編成・乗員１名乗客１名）が脱線した。
直接の原因は、よくわかっていない。交わる線路の変形と急カーブにより、電車の車輪がレールに乗り上がったと考えられる。この交差点では２００７年５月１９日と５月２４日に脱線事故が起きて７月１８日まで運休、２０１５年１０月１１日にも電車の脱線が起き、２０１６年５月２２日までこのルートを通る列車を運休してレールの形を改良していた。
長崎電気軌道では、該当の線路を走る「３系統」を２０１７年１１月２９日まで運休、線路のカーブをゆるくする抜本的な改良を施した。
２０１６（平成２８）年４月１４日（木）２１時２６分頃、熊本県熊本市の九州旅客鉄道九州新幹線熊本・新八代間で、熊本発熊本総合車両所行回送列車（８００系新幹線電車６両編成・乗員１名）のすべての車両が脱線した。
熊本地震が起きたため。脱線現場付近で震度６強や７の揺れが観測された。現場が高架橋で、線路が揺れやすかった。地震による本線上での新幹線の脱線は、２００４年１０月２３日の上越新幹線とき３２５号、２０１１年３月１１日の東北新幹線の試運転列車に次ぐ３例目。新幹線列車の全車両の脱線は史上初。
熊本・新水俣間が４月２６日まで不通。ＪＲ九州は熊本・熊本総合車両所間の線路に脱線防止ガードを設置した。新幹線電車６両が廃車。
２０１６（平成２８）年４月４日（月）１５時１分頃、東京都千代田区の東京地下鉄半蔵門線九段下駅で、中央林間発押上行列車（８０００系電車１０両編成）の乗降扉にベビーカーを挟んだまま発車、ホーム端の柵でベビーカーは大破し、列車は次駅の神保町駅まで走行した。
車掌が扉にベビーカーが挟まれたことに気付かず、運転士に列車の出発を合図したため。列車の発車後に車内とホーム上で非常通報の機器が操作されたが、車掌は列車停止の手配を躊躇（ちゅうちょ）した。
東京メトロでは外部有識者の委員会を設置して再発防止を議論、ヒューマンファクターの観点で社員の養成と異常時の取扱を見直した。加えて各駅でホームの先端部を赤色やゼブラ模様で塗り視認性を向上、この取組は他の鉄道事業者にも広まった。
写真：ホームの先端部を赤く着色した事例（広島県 ＪＲ可部線 あき亀山駅 ２０１７年３月撮影）
２０１６（平成２８）年３月２日（水）１９時５分頃、北海道白糠郡白糠町の北海道旅客鉄道根室本線古瀬・白糠間で、新得発釧路行列車（キハ４０系気動車１両編成・乗員１名乗客４名）が立ち往生。
燃料切れ。暴風雪により前々日から車両の運行計画が度々変わり、給油の予定を入れ忘れたという。
約３時間の不通で列車４本が運休、特急１本が２時間半遅れ。乗客はタクシーで輸送した。ＪＲ東日本では２００５年１月１３日の北上線や１９９０年１１月１４日の釜石線で起きていた燃料切れ立ち往生が、ＪＲ東日本の役員が送り込まれたＪＲ北海道でも起きた。
２０１５（平成２７）年１２月１１日（金）１９時３０分頃、岩手県宮古市の東日本旅客鉄道山田線平津戸・松草間で、宮古発盛岡行列車（キハ１１０系気動車１両編成・乗員２名乗客２２名）が倒木や土砂に乗り上げて脱線した。乗客１名が重傷、乗員１名と乗客１４名が軽傷。
線路際の斜面が崩れたため。
復旧工事のため上米内・川内間が２０１７年１１月４日まで約２年間不通。ＪＲ東日本は列車代行バスを運行せず、鉄道の切符で岩手県北自動車の並行路線バス「１０６急行」に乗れるようにしたため、一日４本の列車が毎時１本のバスに替わり便利になった。２０１０年７月３１日の事故で約３年半の運休のすえ廃止された岩泉線と違い、こちらは廃止されなかった。
現地時間２０１５年１１月１４日（土）１５時３１分頃、フランスのバ＝ラン県ストラスブール＝カンパーニュ郡エックヴェルスハイムのＴＧＶ東ヨーロッパ線の未供用区間で、試験走行中の列車（ＴＧＶ−Ｄａｓｙｅ１０両編成・乗員等５３名）のすべての車両が脱線し転覆した。
運転士のブレーキ操作の遅れにより、時速１７６ｋｍで通過する予定であった曲線を時速２６５ｋｍで通過したためと考えられている。
２０１６年４月３日予定の新線開業が、翌２００７年６月１０日まで延期された。事故の前日にパリ同時多発テロ事件が発生したが、事故との関連はないとされる。
２０１５（平成２７）年８月４日（火）１９時１０分頃、神奈川県横浜市の東日本旅客鉄道根岸線横浜・桜木町間で、下り列車（Ｅ２３３系電車１０両編成・乗員乗客約１０００〜１５００名）が立ち往生した。
運転士が架線の切れ目（エアセクション）で止めた電車を発車したため。通常は列車を止めてはならないエアセクションで止めた列車を発車させる場合、変電所や車両のパンタグラフの操作が必要になるが、これをせずに電車を発車させたため、電流で架線を焼き切った。ＪＲ東日本では２００７（平成１９）年６月２２日にも、埼玉県さいたま市の東北本線で同じトラブルを起こしている。
京浜東北・根岸線が終日運休するなど、横浜エリアのＪＲ各線で列車１５０本が運休、１５９本が最大６時間２０分遅れ、乗客約３５万人に影響。当日は横浜市みなとみらい地区で花火大会が開催されており、帰宅の足を直撃した。ＪＲ東日本では運転士の教育により再発を防止するという。
２０１５（平成２７）年６月３０日１１時３０分頃、神奈川県小田原市の東海旅客鉄道東海道新幹線新横浜・小田原間で、東京発新大阪行列車「のぞみ２２５号」（東海旅客鉄道Ｎ７００系電車１６両編成・乗員９名乗客約９００名）の先頭車の車内で火災が発生し停止した。乗客２名が死亡、乗客２名が重傷、運転士と車掌と乗客２３名が軽傷。
乗客の焼身自殺。車内にガソリンを撒いて火を着けた。他の乗客１名が巻き添えで犠牲に。
東海道新幹線が約３時間不通。火災車両は車体を廃棄し新造車体に振り替えた。ＪＲ東海とＪＲ西日本は新幹線の客室内にも監視カメラを設置、ＪＲ各社は２０１６年４月２８日にガソリン・灯油・軽油の車内持ち込みを禁止した。車両は火災後に自走で移動、新幹線車両の火災への強さが証明された。
２０１５（平成２７）年４月１２日（日）６時１０分頃、東京都千代田区の東日本旅客鉄道「山手線」神田・秋葉原間で２本一組の電化柱が倒れ、もう２本一組の電化柱が傾斜した。
ＪＲ東日本の工事ミス。電車線路の改良工事による電化柱の建て替えで、半月前に２本の電化柱を結ぶ梁を撤去した際、計算ミスにより柱に取り付けた支線を引っ張る強度が足りなくなった。事故の前々夜に電車の運転士が電化柱の傾斜を発見していたものの、改修を事故の翌日に実施することとしていた。
山手線と京浜東北線が約９時間不通となり、乗客約４１万人に影響した。負傷者や列車の衝突や脱線が起きておらず、国の運輸安全委員会は調査の対象としなかったが、公明党の太田昭宏国土交通大臣の発言により「重大インシデント」に認定。ＪＲ東日本では１か月ですべての電化柱を点検し、今後の工事で安全対策を徹底するという。政府の事故への対応について衆参両院の国土交通委員会で取り上げられた。
２０１５（平成２７）年４月３日（金）１７時０７分頃、青森県東津軽郡外ヶ浜町の北海道旅客鉄道海峡線知内信号所・津軽今別駅間の青函トンネルを走行中の、函館発新青森行特急「スーパー白鳥３４号」（７８９系電車６両編成・乗員５名乗客１２４名）の前から２両目で発煙し、緊急停止した。
電車のシステムの不具合で、モーターへ過剰な電流が流れたため、電線が過熱し発煙した。
青函トンネルが約１４時間に渡り不通。ＪＲ北海道では車両のシステムを改修し、青函トンネルの避難マニュアルを見直した。乗客は青函トンネル内を竜飛定点（２０１４年３月まで竜飛海峡駅）まで歩き、ケーブルカー（青函トンネル記念館青函トンネル竜飛斜坑線）で地上へ避難。青函トンネルの防災設備が初めて実際に活用された。
写真：青函トンネルの避難誘導設備（２００７年６月撮影）
２０１４（平成２６）年６月２２日（日）４時１２分頃、北海道上磯郡木古内町の北海道旅客鉄道江差線泉沢・札苅間で、札幌貨物ターミナル発宇都宮貨物ターミナル行貨物列車（ＥＨ５００形式電気機関車１両＋コキ１００系貨車２０両・乗員１名）の後ろから２両目の貨車が脱線し、最後尾の車両が線路上に置き去りにされた。
不詳。急カーブ、貨車に積んだコンテナの中での貨物の偏り、規定内での線路のゆがみ、貨車の揺れ方などが複合的に働き、脱線に至ったと考えられている。泉沢駅付近では２０１２年４月２６日と同年９月１１日にも、貨物列車の脱線が起きていた。
津軽海峡線がほぼ２日間運休。北海道と本州を結ぶ唯一の鉄路が止まり、またまた物流と旅客を足止めした。脱線現場とその周辺の急カーブ区間では時速４５ｋｍの徐行運転を実施。ＪＲ北海道は線路の傾きを改良したうえで脱線防止ガードを増設、ＪＲ貨物はコンテナの重量バランスを測れる荷役機械を導入、左右のアンバランスを１０％以内に抑えるよう荷主に通知した。道路ではよく実施される、かつての軽便鉄道を叩き直して重貨物輸送を担う江差線の改善、急カーブをゆるくするような改良は、鉄道では行われないため、今後も定期的に貨車の脱線が起こる懸念がある。江差線は２０１６年３月から道南いさりび鉄道。
２０１４（平成２６）年２月２３日（日）１時１１分頃、神奈川県川崎市の東日本旅客鉄道「京浜東北線」川崎駅で、桜木町発蒲田行回送列車（Ｅ２３３系電車１０両編成・乗員２名）が、線路上に置かれていた工事用車両に衝突。２両が脱線し、先頭車が転覆。先頭車の運転台にいた乗員の全員が軽傷。
工事業者が車両を線路上に置いたため。駅通路新設工事で、連絡の行き違いや思い込みにより、線路４本のうち列車を止める手続きをしていない線路にまで車両を進めてしまった。
蒲田・鶴見間が丸一日運休。ＪＲ東日本では工事の監督態勢や指示系統を強化、この工事では４線すべての列車が来なくなってから作業を始めることとした。製造後４年ほどの電車２両が廃車。
２０１４（平成２６）年２月１５日（土）０時３０分頃、神奈川県川崎市の東京急行電鉄（東急）東横線元住吉駅で、停車していた渋谷発元町・中華街行列車（東急５０５０系電車８両編成・乗員２名乗客約８０名）に、後続の渋谷発元町・中華街行列車（横浜高速鉄道Ｙ５００系電車８両編成・乗員２名乗客約６０名）が追突した。両列車の乗客７２名が負傷、うち１名は骨折の重傷。
降雪の影響で後続列車のブレーキの利きが悪かったため。車輪とブレーキシューとの間に雪や油やホコリが挟まれて滑りやすくなっていたと考えられる。停車していた列車も元住吉駅に止まれずオーバーランしており、停止位置を直すため後退しようとしていた。
武蔵小杉・日吉間が丸一日運休。東急では降雪時における運転規制やブレーキ使用の基準を明確化した。首都圏鉄道各社でも大雪予報時に列車を間引いたり速度を落とす対策が強化されたように見える。電車は全１６両が廃車。東急はＹ５００系電車の代替として、２０１６年５月に横浜高速鉄道へ５０５０系電車１編成８両を譲渡した。
２０１３（平成２５）年１０月１日（火）１１時３０分頃、神奈川県横浜市の東日本旅客鉄道横浜線中山駅付近の川和踏切で、東神奈川発橋本行列車（２０５系８両編成）に通行人２名が轢かれ、女性が死亡、男性が重傷。
警報機が鳴り遮断機が下りた踏切に侵入したため。踏切内で倒れている男性を助けようと、女性が踏切待ちの車両から下車し、救出を試みたという。
女性の勇気ある行動に対して、メディアが全国へ感動を発信した。政府は女性に紅綬褒章を授与。
２０１３（平成２５）年９月１９日（木）１８時５分頃、北海道亀田郡七飯町の北海道旅客鉄道函館本線大沼駅で、帯広貨物発熊谷貨物ターミナル行貨物列車（１８両編成）の６両目から９両目のコンテナ貨車が脱線した。
軌間の拡大（左右のレールの間隔が広がった）によるもの。検査の結果が保守の基準を超え、本来は修理すべき個所を、検査結果を書き換えるなどして、ＪＲ北海道が放置していた。
事故を機に同様の不正が各地で全社的に発覚し、ＪＲ北海道は政府とメディアから袋叩きに遭った。国土交通省は約１か月かけて監査や査察を実施し、翌年２月には安全統括管理者の解任を命令。ＪＲ北海道は乗客の減少と経費の増加で経営がさらに悪化、元社長の相談役が自殺し、新型車両の開発を中止し、ＪＲ東日本から幹部を招き、駅や路線や列車の廃止に着手した。
２０１３（平成２５）年７月６日（土）１５時４５分頃、北海道の北海道旅客鉄道函館本線山崎・鷲ノ巣間で、札幌発函館行特急列車「北斗１４号」（キハ１８３系気動車８両編成・乗員４名乗客約２００名）の４両目の床下から発煙、出火し、緊急停止した。
ディーゼルエンジンの故障。エンジン内の部品が壊れ、油や燃料が漏れ、発火した。過去の同じような故障への対策が十分でなかったとされる。
ＪＲ北海道では同じエンジンを積む車両３６両の使用を中止、札幌・函館間特急「北斗」４往復が運休するなど同区間の輸送力が半減し、混雑のため他の交通機関の利用を呼び掛けた。他にも特急車両でトラブルが相次いだため、ＪＲ北海道では同年１１月ダイヤ改正で、すべての気動車特急の最高時速を１３０ｋｍから１１０ｋｍまたは１２０ｋｍに引き下げ、以後の特急気動車の製造では高速走行のための車体傾斜をとりやめた。
２０１２（平成２４）年９月２４日（月）２３時５８分頃、神奈川県横須賀市の京浜急行電鉄本線追浜・京急田浦間で、京成高砂発三浦海岸行特急列車（１５００形電車８両編成・乗員２名乗客約７００名）が線路上の土砂に乗り上げ、トンネル内で前３両が脱線した。
集中豪雨でトンネル入口付近の斜面が崩れたため。
金沢八景・逸見間が５５時間半に渡り不通となり、列車１５４８本が運休し約６３万人の足に影響、三浦半島の交通が麻痺した。テレビや新聞などのメディアや国土交通大臣が京急を非難し糾弾する中、インターネット上では短文投稿サイト「ツイッター」を中心に、京急を称賛し応援するメッセージがあふれた。
２０１２（平成２４）年８月６日（月）９時３２分頃、埼玉県熊谷市の秩父鉄道広瀬川原車両基地で、機関車（Ｃ５８形式蒸気機関車）が脱線した。
秩父鉄道では「係員の確認の疎漏が重なった人的ミス」と紹介。具体的な内容は不明。
ＳＬの修理のため、翌２０１３年３月までＳＬ列車「ＳＬパレオエクスプレス」が運休。代わりに電気機関車の牽引による「ＥＬパレオエクスプレス」が走った。
現地時間２０１１年７月２３日（土）２０時３４分頃、中国の浙江省温州市で、橋梁上で停車中の杭州発福州南行Ｄ３１１５列車（ＣＲＨ１Ｂ型電車１６両編成・乗員１，０７２名）に北京南発福州行Ｄ３０１列車（ＣＲＨ２Ｅ型電車１６両編成、乗客５５８名）が追突、停車列車の後２両と追突列車の前４両が脱線し、追突列車の前４両が橋梁から約２０メートル下の地面へ転落した。
落雷による列車の運行管理や衝突防止に関するシステムの故障とされる。落雷により走れなくなったＤ３１１５列車に、運行管理または信号設備あるいは運転士のミスで、Ｄ３０１列車が追突したらしい。
同年８月１６日以降、高速鉄道の各路線で最高速度を落とすダイヤ改正が実施された。高架橋から転落した事故車両を現地で埋め立てたり、事故の後も安全対策を見せないまま運行の再開や路線の拡大をしたことで、中国版新幹線は危険だと、世界各地での高速鉄道の受注競争で日本のメディアがライバルの中国を非難する際に、この事故が必ず引き合いに出されていると思う。
※２０１５年１０月補訂：影響の追記２０１１（平成２３）年５月２７日（金）２１時５５分頃、北海道勇払郡占冠村の北海道旅客鉄道石勝線新夕張・占冠間の第１ニニウトンネル内で、釧路発札幌行特急列車「スーパーおおぞら１４号」（キハ２８３系気動車６両編成・乗員４名乗客２４８名）の前から５両目が脱線し全車両が全焼した。車掌１名と乗客７８名が軽傷。
前から４両目の床下で動力伝達装置が脱落し、最後尾車両の燃料タンクが損傷したため。詳細な原因は特定できなかった。車両の保守や乗客の避難に関して、部署別や現場ごとに異なるルールがあることが指摘された。
車両６両は廃車。全焼し車体が曲がった特急車両の写真や映像に世間や鉄道ファンが衝撃を受けた。車両不足により「スーパーとかち」一部列車に短編成化、グリーン車やバリアフリー対応車両の非連結、キハ１８３系気動車での代走が発生した。ＪＲ北海道ではマニュアルを改訂。同年９月には社長が自殺。
※２０１５年１１月補訂：運輸安全委員会の報告書に基づき負傷者内訳と原因を訂正２０１０（平成２２）年１２月１７日（金）２１時５０分頃、兵庫県神戸市の西日本旅客鉄道山陽本線舞子駅で、姫路発米原行快速列車（電車１２両編成）から降りた客が線路に転落、列車に轢かれて死亡した。
客がホームから線路へ転落した箇所は、先頭車両同士の連結部であり、車両に転落防止ガードを付けていなかった。
ＪＲ西日本では先頭車両同士の連結部でも前照灯を点灯し、客への気づきを促した。加えて一部の在来線電車と以後の在来線向け新型電車では、先頭車両にも転落防止ガードを設置し、客が線路へ落ちにくいようにした。
写真：ＪＲ西日本２２７系電車の転落防止ガード（２０１７年３月撮影）
２０１０（平成２２）年７月３１日（土）７時３５分頃、岩手県下閉伊郡岩泉町の東日本旅客鉄道岩泉線押角・岩手大川間で、茂市発岩泉行列車（キハ１１０形１両編成・乗員２名乗客７名）が線路上の土砂に乗り上げ脱線した。運転士１名と乗客３名が軽傷。
前日の降雨や斜面の風化のため、線路脇の崖が崩れたため。現場は建設時に崖崩れを予測し、あらかじめ落石シェルターを備えていたが、崩れた土砂の量が多く、線路上にも一部がこぼれていた。
多額の対策費用と利用者の少なさで、ＪＲ東日本は地元に鉄道の廃止とバス路線への転換を協議。マイクロバスでの代行輸送が続いたまま、２０１４年３月限りで岩泉線は廃止された。
現地時間２０１０年７月２３日（金）１２時頃、スイスのバレー州のマッターホルン・ゴッタルド鉄道ラックス・フィーシュ間で、観光列車「グレーシャーエクスプレス（氷河特急）」（電気機関車＋客車６両、乗客約２１０名）の後部３両が脱線し、うち後部２両のパノラマ１等車が転覆した。
列車の速度超過のため。運転士が時速３５ｋｍ制限の曲線を抜けた直後に加速したため、曲線内にいた後部車両が時速約５６ｋｍまで加速、最後尾車両から転覆が始まったと思われる。
ＪＴＢとＡＮＡの日本人ツアー客が事故に巻き込まれ、１名が死亡し３８名が負傷したため、日本国内で大きく報道された。なお、氷河特急とは過去に氷河急行と訳されていた列車と同じ。
※２０１２年９月補訂：事故名の変更と影響での注釈の追記２０１０（平成２２）年１月２９日（金）１２時２５分頃、北海道深川市の北海道旅客鉄道道函館本線妹背牛・深川間の深川６号線踏切で、旭川発札幌行特急列車「スーパーカムイ２４号」（７８９系電車５両編成・乗員２名？乗客１０２名）がダンプカーと衝突、先頭車両が脱線した。運転士１名と乗客約２３名が負傷。ダンプカーの運転手は軽傷。
吹雪の中でダンプカーが遮断機の下りた踏切に進入したもの。スリップが原因か。
滝川・旭川間が丸一日不通。ＪＲ北海道は５月から特急列車の先頭車貫通路を立入禁止とし、６月にリゾート列車「クリスタルエクスプレス」の先頭部座席を撤去した。